Der Senat ist das oberste Organ der Akademie der Naturwissenschaften Schweiz. Er setzt sich aus den Delegierten der Mitgliedorganisationen und der Kommissionen zusammen und wird vom Zentralvorstand jährlich zur Sitzung einberufen. Der Senat entscheidet über die Prioritäten und Direktion der Akademie, die Schaffung neuer Kommissionen und Unternehmungen sowie über die Aufnahme neuer Mitglieder.

102. ausserordentliche Sitzung des Senats in Bern, 15. September 2006

Zur Strukturreform der Akademie der Naturwissenschaften Schweiz SCNAT fand am 15. September 2006 eine ausserordentliche Senatssitzung statt. Diese fasste nach intensiven Diskussionen folgende konsultativen Beschlüsse zuhanden des Vorstandes:
Der Zentralvorstand hat die Einsetzung von fünf Plattformen (siehe unten) zuhanden der Delegiertenversammlung vom 12. Januar 2007 vorbereitet. Ebenso hat der Zentralvorstand die Geschäftsordnung der Plattformen zu Handen des neuen Vorstands überarbeitet und die geplante Road Map umgesetzt.

Die Bezeichnungen der genannten Plattformen lauten:
- Plattform Chemie
- Plattform Biologie,
- Plattform Naturwissenschaften und Region,
- Plattform Geowissenschaften sowie
- Plattform Mathematik, Astronomie und Physik